| 1 | (39) | 梶本 和 | 1:14:12 | 東京大学 3 |
| 2 | (57) | 及川 悠太郎 | 1:14:51 | 筑波大学大学院 4 |
| 3 | (63) | 堀井 聡一朗 | 1:16:55 | 東京理科大学 4 |
| 4 | (62) | 竹林 寛生 | 1:18:58 | 京都大学 3 |
| 5 | (15) | 森 創之介 | 1:19:27 | 横浜国立大学 4 |
| 6 | (38) | 高橋 悠 | 1:19:55 | 横浜市立大学 3 |
| 7 | (31) | 斉藤 大己 | 1:20:33 | 筑波大学 3 |
| 8 | (61) | 宮澤 晃永 | 1:21:19 | 東北大学 4 |
| 9 | (33) | 寺嶋 謙一郎 | 1:21:20 | 東京農業大学（オホーツク） 4 |
| 9 | (41) | 木明 拓玖 | 1:21:20 | 筑波大学 4 |
| 11 | (23) | 古角 海志 | 1:21:21 | 東北大学 4 |
| 12 | (51) | 鈴木 寛人 | 1:23:28 | 名古屋大学 4 |
| 13 | (58) | 西澤 汰知 | 1:24:15 | 東北大学 4 |
| 14 | (17) | 大森 寛玖 | 1:24:22 | 東京大学 3 |
| 15 | (21) | 栗田 稜也 | 1:25:10 | 東京大学 4 |
| 16 | (45) | 加藤 賢斗 | 1:25:32 | 筑波大学 3 |
| 17 | (55) | 世古 大介 | 1:26:12 | 東北大学 4 |
| 18 | (37) | 八田 湘斗 | 1:26:56 | 立命館大学 2 |
| 19 | (20) | 鈴木 悠太 | 1:27:49 | 東北大学 4 |
| 20 | (25) | 尾藤 碩 | 1:27:55 | 京都大学 2 |
| 21 | (1) | 小浦 姿 | 1:28:04 | 北海道大学大学院 4 |
| 22 | (32) | 中澤 渓進 | 1:29:44 | 東北大学 3 |
| 23 | (56) | 大石 涼太 | 1:29:54 | 日本大学 3 |
| 24 | (29) | 山口 颯大 | 1:30:08 | 東京大学 4 |
| 25 | (36) | 平岡 祐馬 | 1:30:28 | 東北大学 4 |
| 26 | (27) | 高野 真人 | 1:31:05 | 横浜国立大学 4 |
| 27 | (60) | 早川 正真 | 1:31:06 | 立命館大学 4 |
| 28 | (40) | 山本 匠海 | 1:33:43 | 名古屋大学 2 |
| 29 | (22) | 中嶋 啓太 | 1:33:58 | 筑波大学 3 |
| 30 | (48) | 齋藤 洋紀 | 1:34:04 | 東北大学 3 |
| 31 | (34) | 山村 瑛 | 1:34:54 | 東北大学 4 |
| 32 | (3) | 柴田 日向 | 1:34:55 | 名古屋大学 3 |
| 33 | (42) | 坂本 拓登 | 1:36:59 | 北海道大学 4 |
| 34 | (52) | 持地 怜太朗 | 1:37:05 | 慶應義塾大学 3 |
| 35 | (18) | 藤原 考太郎 | 1:37:20 | 筑波大学 4 |
| 36 | (44) | 福室 凜 | 1:38:07 | 早稲田大学 3 |
| 37 | (7) | 坪井 亮哉 | 1:38:52 | 東北大学 4 |
| 38 | (5) | 横江 明弘 | 1:39:31 | 神戸大学 4 |
| 39 | (9) | 泉谷 光紀 | 1:39:47 | 東北大学 4 |
| 40 | (35) | 福井 陽貴 | 1:39:54 | 徳島大学 3 |
| 41 | (43) | 佐藤 仁 | 1:40:31 | 筑波大学 2 |
| 42 | (28) | 水野 伶哉 | 1:40:35 | 名古屋大学 3 |
| 43 | (19) | 加藤 優拓 | 1:40:43 | 広島大学 4 |
| 44 | (49) | 杉中 海斗 | 1:42:59 | 京都大学 4 |
| 45 | (26) | 泉田 弥壱 | 1:44:19 | 北海道大学 4 |
| 46 | (12) | 藤ノ木 智大 | 1:48:28 | 千葉大学 3 |
| 47 | (2) | 井口 涼羽 | 1:51:33 | 早稲田大学 2 |
| 48 | (4) | 町田 禎悟 | 1:53:48 | 京都大学 3 |
| 49 | (8) | 小河 凜太郎 | 1:54:46 | 大阪公立大学 2 |
| 50 | (30) | 吉野 耀介 | 1:56:09 | 北海道大学 4 |
| 51 | (47) | 梅園 雅史 | 1:56:31 | 筑波大学 3 |
| 52 | (11) | 馬場 崚輔 | 1:57:04 | 東北大学 2 |
| 53 | (59) | 田中 周良 | 1:58:57 | 京都大学 3 |
| 54 | (6) | 森田 龍雲 | 2:07:32 | 新潟大学 4 |
| 55 | (14) | 中沢 千聖 | 2:15:20 | 新潟大学 3 |
| (50) | 石原 尋季 | MP | 京都工芸繊維大学 3 | |
| (53) | 田中 雅崇 | MP | 筑波大学 4 | |
| (10) | 古吟 健晟 | MP | 横浜国立大学 4 | |
| (24) | 野口 彰洋 | MP | 新潟大学 3 | |
| (16) | 泉浦 旭秀 | MP | 法政大学 4 | |
| (46) | 清水 豪希 | MP | 岩手大学 3 | |
| (54) | 青木 悠真 | MP | 早稲田大学 4 | |
| (13) | 福嶋 崇 | DISQ | 早稲田大学 2 |